דוד אלחייני, יו"ר מועצת יש"ע, מתח ביקורת חריפה על תוכנית המאה: "זאת סכנה קיומית למדינת ישראל. אני לא רוצה שהאמריקנים יקבעו מהם האינטרסים הלאומיים שלנו. האינטרס הגדול ביותר שלי הוא שתהיה ריבונות - אם אני אומר שצריך לוותר על הריבונות בגלל שזו סכנה קיומית, זאת לא משיחיות".