פערים נוספים התגלו בתיק 4000 שמעלים את הסברה כי בתיק בו נחשד ראש הממשלה בנימין נתניהו לא היה דבר. אלי ציפורי שוחח עם אראל סג"ל וד"ר גדי טאוב וסיפר על המסמך המשמעותי שחשף, המציג הליך פעולה מקובל בתחום הרגולציה, על אף שחוקרי הפרשה והיועץ המשפטי לממשלה לא ידעו על כך דבר. סג"ל בתגובה: "תיק 4000 הוא אחד המסוכנים בישראל".