ראש השב"כ לשעבר יעקב פרי התייחס לדבריו מעוררי המחלוקת של ד"ר מרדכי קידר. "כששמעתי את הדברים שלו מאוד הופתעתי", אמר בקבינט של 103fm. "למרות שהכרתי אותו, עוד יותר הופתעתי כשראיתי את הסקר שהתפרסם באחת המהדורות שאומר שיותר מ־20 אחוזים מהישראלים חושבים שצריך להעניק חנינה ליגאל עמיר. כמעט רבע מהציבור חושב שהייתה כאן קונספריציה".
יואב לימור תהה מדוע הגענו למצב שהציבור איבד אמון. "הציבור לא מאמין לשומרי הסף למוסדות החוק. ההתקפה שכולם חווים חדשות לבקרים בימים אלה. תאוריות קונספירציה מיד לאחר הרצח היו למכביר - חלקן גם טענו שמדובר בפעולה של השב"כ, זאת שטות שאי אפשר להעלות על הדעת, יש אנשים שכך מאמינים שהאמון שלהם במערכות הצדק של מדינת ישראל התערערה זאת סימונה של התקופה".
בהמשך שיתף בתחזית קשה במיוחד, ואמר: "אנשים שחושבים שעל ידי רצח הם יכולים לשנות מהלכים היסטוריים. אני חושב שיש מספר אישים ודמויות ששירות הביטחון צריך לפקוח את עיניו לגביהם".