דו"ח מבקר המדינה חשף ליקויים קשים עד מאוד בהתנהלותה של המשטרה ושל השב"כ בערים המעורבות במהלך מבצע שומר החומות. על פי הדו"ח, נראה כי המערכת להפקת מודיעין גלוי לא פעלה, כי היו מעט מדי שוטרים ואלו שכן נמצאו - סבלו ממחסור גדול בציוד. הכתב והפרשן צבאי יוסי יהושוע ('ידיעות אחרונות'), הביא את כל הפרטים.