בעת שצה"ל פועל ברצועת עזה המתיחות בין הדרג הצבאי לדרג המדיני גוברת. השר עמיחי אליהו התייחס לדעות הרמטכ"ל בקבינט וליום שאחרי ברצועת עזה.
תחילה הביע את דעתו על הרמטכ"ל: "יש הרבה דברים בהם הרמטכ"ל הצליח, ויש דברים שהוא צריך לעשות כפי שהדרג המדיני מבקש ממנו לעשות. מותר לו לחלוק ולהתווכח, אך בדמוקרטיה מי שמכריע זה הדרג המדיני".
על הדרג הביטחוני אמר: "זה טוב שהדרג הביטחוני אומר את עמדותיו, חשוב מאוד שבשולחן שמקבלים החלטות יעלו כל השיקולים, אך היחידים שנותנים את הדין לציבור, אלו נבחרי הציבור".
כשנשאל על הביקורת שלו על המטכ"ל אמר: "צריך להקשיב לרמטכ"ל, אבל לדייק אותו. ההיסוסים שלו לא נכונים, התדרוכים שלו נגד הדרג המדיני לא נכונים, ההדלפות מתוך מחלוקות, הוא מדליף הכול. פוליטיקאים שמדליפים זה לגיטימי. ברגע שגנץ יצא מהממשלה אנחנו רואים פחות הדלפות. מה שאני אומר, זה שלא לגיטימי שראש המערך הצבאי הלוחם (הרמטכ"ל) יפעל נגד הוראה מפורשת של הדרג המדיני. אני מזכיר כי הרמטכ"ל נקרא מספר פעמים לשר הביטחון ליישר את עמדותיו", טען אליהו.
עוד הוסיף: "אם הוא יבצע את הוראות הדרג המדיני הכי טוב שיש שימשיך. דעתו של הרמטכ"ל לא נחשבת, ברגע שהוא קיבל פקודה אז הוא צריך לבצע את הפקודה. בשביל מה אנחנו הולכים לבחירות? איך אתם רוצים לנהל את המדינה? אם הוא עושה שיישאר, אם הוא לא עושה שלא יישאר". בנוסף לכך, הדגיש: "יש ימים שהוא פועל ויש ימים שהוא לא פועל. הרמטכ"ל צריך לעשות בצורה הטובה ביותר את ההוראות שהוא קיבל".
על דבריו של השר סמוטריץ' כי עזה היא 'בוננזה של נדל"ן', אמר: "צריך להחיל שם ריבונות, לא רואה את סוגיית עזה כסוגיה כלכלית. זו ארצנו, חובתנו לייצר הרתעה. למה זה לא מוסרי? מה שונה מ-48'?".
בהמשך התייחס לנושא החטופים: "המשימה היא לא רק החטוף הנוכחי, היא שלא יהיו בכלל חטופים. הגישה שלי היא לא להסתכל על כאן ועכשיו, אלא גישה אחראית שמסתכלת על כך שלא היו יותר חטופים בעתיד. אי אפשר לנצח מלחמה בלי לקחת סיכון".