בראיון לגבי גזית השיב ח"כ מרגלית לתשובת עוה"ד של ראש הממשלה לעתירה לבג"צ, הדורשת לפתוח בחקירה בפרשת הצוללות: תשובתם הלא עניינית מחזקת את התחושה שנתניהו מעורב אישית בפרשה. מקורביו השתלטו על עסקת הנשק הגדולה בתולדות המדינה, מה שהופך דמוקרטיה לרפובליקת בננות. בטוח שבג"צ יורה למשטרה וליועמ"ש לחקור
בעוד כשבועיים צפוי בג"צ להכריע בעתירה שהוגשה על ידי חבר הכנסת אראל מרגלית מ"המחנה הציוני" וחבר מפלגת "העבודה" אלדד יניב, אשר דורשים להורות ליועץ המשפטי לממשלה אביחי מנדלבליט ולמשטרה, לפתוח בחקירה פלילית נגד ראש הממשלה בנימין נתניהו בפרשת הצוללות, המכונה "תיק 3000". עורך הדין יוסי כהן, שהשיב לעתירה לבג"צ בשם ראש הממשלה, טען אתמול שהשיטה של מרגלית גובלת בשיבוש הליכי חקירה ושמטרתו המרכזית היא האדרת שמו במסגרת הקמפיין שלו לראשות מפלגת "העבודה". ח"כ מרגלית הגיב הבוקר בראיון לגבי גזית: "הבג"צ יידון בתחילת חודש מרץ ואז נראה מה הוא יגיד. עורכי הדין של נתניהו בוחרים שלא להתייחס לאף טענה עניינית, מה שמחזק מאוד את התחושה שראש הממשלה מעורב אישית בפרשה".
"מי שראה את הסרט 'צוללים לשחיתות' שנמצא ברשת, יכול לצפות בכמה דברים מאוד חמורים שאני מציג שם", אמר ח"כ מרגלית. "הראשון הוא שיש מסמך המראה ששולם שוחד באחת מעסקאות הצוללות הגדולות של ישראל. השני הוא שיש מסמכים אחרים, מאוד מפורטים, שמראים איך אותה חברה עצמה שיחדה שני ראשי מדינות אחרים, כולל העברות כספים. השלישי הוא אמירות מאוד קשות על כך שנתניהו הכניס את אנשיו הקרובים לתוך העסקה, להיות מתווכחים, ב-2009, ברגע שהוא נכנס. הרביעי הוא מכרז בין חמש מדינות, שהיו באמצע המכרז, גרמניה בכלל לא הייתה בין המובילות, הוא בוטל, ואחרי שנה חזרו רק הגרמנים בלי מכרז כלל. השישי הוא שבוגי יעלון העיד שהוציאו אותו מהעסקה והעבירו אותה ממשרד הביטחון למשרד ראש הממשלה. השביעי הוא שחמישה ימים אחרי שהבאתי את הדו"ח הקודם, על מי הבעלים של המספנה, שהוא שר הביטחון הלבנוני, שבונה לנו את הספינות, פשטו מהמשטרה על משרד הביטחון והחרימו מסמכים".
"זה כבר לא בדיקה, יש פה עדויות לשוחד", טען ח"כ מרגלית. "אני לא אומר בדיוק מי מעורב, למרות שיש לי הרבה יותר פרטים שלא פרסמתי כלל, כי אני מרגיש אחריות והעברתי את זה למשטרה בלבד. מה שאני מבקש, זה תעברו בבקשה מבדיקה לחקירה, כי כל יום שזה לא נחקר בחקירה, זה זמן לשיבוש ראיות. עובדה שחלק מהבדיקות נהיו לאחרונה הרבה יותר רציניות, אחרי שהנחנו מסמכים על השולחן של המשטרה והיועמ"ש. אני חושב שזה עניין קשה מאוד, כי האדמה רועדת. זו עסקת הנשק הגדולה ביותר בתולדות מדינת ישראל. כל מיני אנשים מעורבים בתוך הסיפור הזה. אני חושב שקשה מאוד להיכנס אליו, כי זה כמו להיכנס לשדה מוקשים ואתה פתאום נוגע במקומות מאוד קשים. אני מבקש שיחקרו את זה, שייכנסו לעומק. אם אני מביא מסמכים באמצעי הדלים, אז אולי אתם יכולים להביא הרבה יותר ולרדת לשורש האמת".
גזית שאל את ח"כ מרגלית האם הוא אכן מצפה שבג"צ יחייב את המשטרה והיועמ"ש לפתוח בחקירה פרונטלית בפרשת הצוללות. "אני בטוח שכן ואני בטוח שזה ייפתח", השיב מרגלית, "יש פה סימנים לאחת העסקאות הבלתי הגיוניות, עסקת הנשק הגדולה ביותר בתולדות ישראל, שהשתלטו עלי מקורביו של ראש הממשלה".
על דו"ח מבקר המדינה בנושא מבצע "צוק איתן" אמר ח"כ מרגלית: "אני שירתי ב'עורב גולני'. החיילים של היחידה, שהם הרבה יותר צעירים ממני, נכנסו לסג'עייה בעזה עם נגמ"שי 'זלדה' משנות החמישים במקום עם נגמ"שי 'נמר'. ריבונו של עולם. אפודים קראמיים לא היו. עשינו מגבית לקנות מנות קרב. אני יושב בוועדת התקציב של ועדת חוץ וביטחון ואני רואה כמה כספים אנחנו מעבירים לביטחון. אני יודע שמשרד הביטחון וצה"ל מקבלים הרבה מאוד מאוד כספים, הרבה יותר ממה שאנחנו מדמיינים. ואני מצפה שסדר העדיפויות יהיה אמיתי, ושלא יערבבו ביטחון עם זה, שמי שקרוב למקבלי ההחלטות גוזר קופון. כי אז זה הופך מדינה מדמוקרטיה לרפובליקת בננות. זו התמוטטות של כל המערכת".